Proteinas
Los nucleotidos
Los azucares
Los acilgliceridos
Se agrupa en cuatro clases princiupales
Los Terpenos o Terpenoides
Constituyen el grupo mas numerosos de metabolitos secundarios (mas de 40.000 moleculas diferentes), Estos compueston dan lugar, tanto metabolitos primarios como secundarios, de gran importancia para el crecimiento y supervivencia de la planta, entre los metabolitos primarios se encuentran hormonas(giberelinas,acido abscisico,y cito quininas,caratenoides, clorofilas y plastoquinonas (Fotosintesis), ubiquinonas, (respiracion) y esteroles.
Los Compuestos Fenolicos
Las plantas sintetizan, una gran variedad de productos secundarios, que contienen un grupo fenol, estas sustancias reciben el nombre de compuestos fenolicos,polifenoles o fenilpropanoides y derivan todas ellas del fenol, un anillo aromatico, con un grupo hidroxilo.
Los Glicosidos
Su nombre hace referencia al enlace glicosidico, se forma cuando una cadena de azucar se condensa, con otra que contiene un grupo hidroxilo, Existen tres grupos de glicosidos: Las saponinas, Glicosidos Cardiacos,Glicosidos Cianogenicos.
Los Alcaloides
Son mas de 15.000 metabolitos secundarios, que tienen en comun, tres caracteristicas: Son solubles en agua,Contienen al menos un atomo de nitrogenos en la molecula y exhiben actividad biologica.